旗山與大樹之間有條旗山斷層﹐東側岩層剖面之年代並不一致﹐嶺口、尚和附近砂岩為早期上新世﹐接近義守大學附近為晚期上新世或者更新世﹐嶺口礫岩與南勢崙砂岩之間有不整合面﹐發生年代可溯自嶺口礫岩下斷沉積時開始。
旗山斷層兩側古亭坑層與橫山石灰岩之年代為晚期上新世或更新世。嶺口礫岩下段有更新世之重要指示化石︰Gephyrocapsa Oceanica。

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旗山斷層是活的